毛細(xì)管電泳可以按操作方式重新分為手動(dòng)、半自動(dòng)及全自動(dòng)型毛細(xì)管電泳。

　　二：分離通道形狀

　　按分離通道形狀分為圓形、扁形、方形毛細(xì)管電泳等。

　　三：緩沖液的介質(zhì)

　　根據(jù)配制緩沖液的介質(zhì)的不同，可以把CE分為水相毛細(xì)管電泳儀和非水毛細(xì)管電泳儀。是以有機(jī)溶劑作介質(zhì)的電泳緩沖液代替以水為介質(zhì)的緩沖溶液，增加了疏水性物質(zhì)的溶解度，特別適用于在水溶液中難溶而不能用CE分離的物質(zhì)或在水溶液中性質(zhì)相似難以分離的同系物，拓寬了CE的分析領(lǐng)域。

　　四：毛細(xì)管電泳儀具備如下優(yōu)點(diǎn)：

　　（1）高效塔板數(shù)目在標(biāo)準(zhǔn)間，當(dāng)采用CGE時(shí)，塔板數(shù)目可達(dá)標(biāo)準(zhǔn)間以上；

　?。?）快速一般在十幾分鐘內(nèi)完成分離；

　　（3）微量進(jìn)樣所需的樣品體積為nL級(jí)；

　?。?）多模式可根據(jù)需要選用不同的分離模式且僅需一臺(tái)儀器；

　?。?）經(jīng)濟(jì)實(shí)驗(yàn)消耗不過(guò)幾毫升緩沖溶液，維持費(fèi)用很低；

　?。?）自動(dòng)CE是目前自動(dòng)化程度較高的分離方法。

　　五：缺點(diǎn)是：

　?。?）由于進(jìn)樣量少，因而制備能力差；

　?。?）由于毛細(xì)管直徑小，使光路太短，用一些檢測(cè)方法（如紫外吸收光譜法）時(shí)，靈敏度較低；

　　（3）電滲會(huì)因樣品組成而變化，進(jìn)而影響分離重現(xiàn)性。